[엑스맨]
인간의 생활을 보다 윤택하고자 유전자기술 발전으로 탄생한 돌연변이 엑스맨들은 인간들의 편견과 적대감으로 인해 사회에서 소외되어 가고 있다. 또한 인간들은 엑스맨의 초능력에 대한 두려움으로 그들의 권한을 축소하기 위해 법안을 만들어 의회에 제출한다. 한편 엑스맨들은 두 진영으로 갈라져 있는 데 인류와 평화롭게 공존하고자 하는 사비에 박사팀과 인간을 지배하는 야망을 꿈꾸는 매그니토 팀이다. 로그(안나 파킨)는 언제가는 캐나다를 멋지게 여행할 꿈을 꾸는 10대 소녀. 그러나 그녀의 몸을 만지기만 하면 의식을 잃거나 죽고마는 돌연변이 인간이다. 가출하여 여행을 하다 한 선술집에서 손등에서 금속칼날이 나오는 울버린이란 돌연변이 사나이를 만난다. 이들은 매그니토가 세계정복을 위하여 필요한 희생양들. 납치하려 하지만 사비에 박사는 음모를 눈치채고 저지하기에 이른다.

[엑스맨2]
가까운 미래. 유전자 기술의 거듭된 발전으로 초인간적인 능력을 지닌 돌연변이들이 생겨난다. 이러한 돌연변이의 초능력이 인류를 위협할 것이라고 생각한 몇몇의 극단적인 인간들을 중심으로 돌연변이들을 격리 수용하는 등록법안을 만들어 이를 통과시키려는 계획을 세운다. 이 법안에 대한 지지 여론이 높아지면서 돌연변이와 인간의 관계는 더욱 악화된다.
그러던 어느 날, 신원이 밝혀지지 않은 누군가가 백악관을 공격, "돌연변이에게 자유를"이라는 메시지를 남기고 사라진다. 이 사건으로 인해 줄기차게 돌연변이 격리를 요구해온 강경파가 목소리를 높이고, 과학자이자 전직 장성인 스트라이커는 군대를 동원해 본격적인 돌연변이 청소를 시작한다. 그는 첫번째 단계로 엑스맨의 정신적 지주인 사비에 박사(패트릭 스튜어트 분)를 공격한다. 이에 돌연변이들끼리 연대할 필요성을 느낀 매그니토 박사(이안 맥켈런 분)는 감옥에서 탈출하여 사비에 박사를 구하고, 울버린(휴 잭맨 분), 스톰(할 베리 분) 등의 엑스맨에게 인간과의 전면전을 함께 할 것을 제안하는데…

[엑스맨3]
다양하고 초인적인 능력을 가진 돌연변이들에게 그들이 가진 능력을 조절할 수 있도록 가르쳐 인류를 위해 그 힘을 사용하길 희망하는 ‘엑스맨’. 그리고 자신들을 몰아내려는 인간사회에 등을 돌리고 돌연변이가 미래를 지배할 것이라 믿는 ‘브러더후드’의 대립이 계속되는 가운데, <엑스맨: 최후의 전쟁>에서는 다양하고 흥미로운 능력을 가진 돌연변이 캐릭터들의 등장과 그들의 능력을 치유할 수 있는 ‘큐어’의 등장으로 세상의 모든 전쟁을 잠재울 최후의 전쟁으로 이어진다.

<엑스맨: 최후의 전쟁>에서 돌연변이들은 치료제 ‘큐어’의 등장으로 역사적 위험에 처하게 된다. 이제 초능력을 치유할 수 있는 선택권을 가지게 되는 대신 그로 인해 고립되며 소외된다. 만약 그것을 원치 않는다면 초능력을 포기한 평범한 인간이 되어야 하는 것.

한편, 알칼리 호수에서 사라져 죽은 줄로만 알았던 '진 그레이'가 회생하여 돌아오고 '사비에'는 그녀의 숨겨진 이중자아 '피닉스'의 부활을 예감, 위험을 경고한다. 모든 상황을 인내해야 한다고 주장하는 엑스맨의 리더 '사비에 교수’와 적자생존의 법칙을 신봉하는 ‘매그니토’의 대립된 의견이 시험대에 오르고, 이는 세상의 모든 전쟁을 잠재울 최후의 전쟁으로 이어진다.