#1. Time Has Come Today
병원 무도회 다음 날, 데니의 죽음으로 이지는 공황상태에 빠져 움직이지조차 못하고 집에서 나오려 하지 않는다. 한편, 페스트로 의심되는 환자를 수술했던 셰퍼드는 조지와 함께 질병관리국 담당관에 의해서 병원 락커룸에 격리되는데…

#2. I am a tree
버크가 입원하자 그의 부모님이 병원에 찾아오고, 크리스티나는 버크의 어머니 때문에 스트레스를 받는다. 셰퍼드와 핀 둘 사이에서 고민하던 메러디스는 결국 한 명을 선택하지 못하고 두 사람과 모두 데이트를 해보기로 결심한다. 한편, 병원 지하에서 생활하던 캘리는 웨버과장에서 들켜 짐을 싸게 되는데….

#3. Sometimes a Fantasy
메러디스는 셰퍼드와 핀을 경쟁 붙여놓고 두 남자의 애정 공세에 즐거워한다. 반면 애디슨은 마크를 다시 만나지만 서글픈 마음은 사라지지 않는다. 한편, 알렉스는 몸에 어떤 상처가 나도 통증을 느끼지 못하는 꼬마 환자 매건을 맡게 되는데….

#4. What I Am
메러디스가 갑작스럽게 맹장 수술을 받게 되고, 이 와중에도 셰퍼드와 핀은 그녀에게 점수를 따려고 노력한다. 버크는 손의 떨림 현상 때문에 불안해하지만, 크리스티나는 걱정할 것 없다며 버크를 위로한다. 한편, 이지가 돈 때문에 데니를 유혹한 거라고 오해한 데니의 아버지가 이지를 찾아오는데….

#5. Oh, the Guilt
병원에서는 한 달에 한번 열리는 사망 원인 분석 토론회가 열리고, 데니의 케이스가 도마에 올려진다. 그 결과 책임자였던 버크와 베일리가 의사들로부터 질책을 당한다. 한편 버크는 손떨림 증상이 개선되지 않자, 이 사실을 웨버에게 말하려고 하는데…

#6. Let the Angels Commit
이지는 병원에 다시 출근 하지만 징계기간동안은 환자를 맡을 수 없는데다 자신의 공백기간동안 조금은 변해버린 병원에 낯설어 한다. 한편, 크리스티나는 버크의 수술에 일일이 개입하고 버크가 시술이 어려운 부분은 자신이 나서서 해결하기 위해서 온갖 노력을 다하는데….

#7. Where the Boys Are
셰퍼드는 복잡한 마음을 정리하기 위해서 낚시 여행을 계획하고, 버크를 초대한다. 그러나, 버크가 웨버, 조지, 알렉스를 초대하는 바람에 결과적으로 마음이 더욱 복잡해진다. 한편 병원에 남은 닥터 슬론에게 성전환 수술 환자 도나가 찾아오고, 슬론은 캠핑을 떠난 알렉스 대신 메러디스에게 도움을 요청하는데….

#8. Staring At the Sun
조지의 아버지가 쓰러져 갑작스럽게 병원에 입원한다. 조지 아버지는 검사 결과 식도암 3기의 위독한 상태로 더군다나 암 수술을 받기 위해서는 먼저 심장 판막 교체수술 수술을 받아야하는 위험한 상황이라는 것이 밝혀진다. 조지는 아버지의 심장수술을 버크에게 부탁하려고 하지만 버크의 손이 정상이 아니라는 사실을 이상을 눈치 채게 된다. 한편, 이지는 알렉스가 자신을 좋아하는 감정이 남아있다는 사실을 알게 되는데….

#9. From a whisper to a Scream
조지는 아버지의 심장 판막교체 수술을 버크가 맡게 되자 버크 대신 에리카를 수술 집도의로 초빙한다. 이런 조지의 행동에 대해서 부모님을 포함한 많은 사람들이 이유를 납득 못하지 못하고, 급기야 가족들은 수술을 다시금 버크에게 맡긴다. 한편, 웨버는 버크를 불러 은퇴할 계획을 얘기하고 자기 후임으로 버크를 이사회에 추천했다고 말한다. 이 말을 들은 버크는 손의 이상에 대해서 더 이상 숨길 수 없다고 판단하는데….

#10. Don't Stand So Close To Me
드디어 크리스티나와 버크의 합작사건이 드러나고 이들은 병원에서 눈총을 받는다. 조지의 아버지는 에리카에게 심장수술을 받고 인턴으로 수술에 참여한 크리스티나는 버크에게서 잘 배웠다는 에리카의 칭찬을 듣는다. 한편, 샴쌍둥이인 제이크와 피트가 입원해 병원의 의료진은 총출동해 수술에 참여하는데, 버크의 손떨림 현상으로 자신감을 상실한 셰퍼드는 갈등하지만 결국 분리수술에 성공한다.

#11. Six Days - Part 1
조지 아버지는 암 수술을 앞두고 웨버를 찾아와 암이 다른 장기에도 퍼져 있더라도 수술을 포기 하지 말고 종양을 모두 들어내 줄 것을 부탁한다. 전이가 심할 경우에는 수술을 하지 않고 퇴원시키는 것이 일반적인 경우이지만 웨버는 암과 싸우겠다는 조지 아버지의 의지를 존중해서 위험을 무릅쓰고 암세포를 절제한다. 한편, 메러디스의 아버지 대처는 손녀딸 로라 때문에 계속 병원에 머물게 되는데….

#12. Six Days - Part 2
메러디스의 코골이 땜에 잠을 설치는 셰퍼드는 참다 못해 메러디스에게 수술할 것을 권유한다.　이지는 수표를 은행에 넣은 후, 수술비 땜에 고민하는 헤더에게 익명으로 3십만 달러를 기증한다. 이 사실을 눈치 챈 베일리는 이지의 선행을 인정하지만 그녀가 환자와 거리두기에 또 다시 실패한 것이라며 꾸짖는다.　한편, 조지는 무리한 수술 강행으로 아버지가 다시 깨어나는 것조차 점차 어려워지자, 아버지의 상태가 원래부터 가망이 없었다는 걸 알게 된다.

#13. Great Expectations
아버지를 잃은 슬픔을 감내하는 조지를 보며 이지는 가슴 아파한다. 웨버의 은퇴소식에 전문의들은 서로 그 자리를 탐내고, 베일리는 어린 자궁암 환자를 맡게 되면서 조기진단의 필요성을 다시 한번 절실히 느끼며 무료진료소 개소를 강력히 추진한다.　데니가 남긴 8백만 달러를 좋은 일에 쓰고 싶었던 이지는 결국 이 돈을 무료진료소 건립기금으로 내놓는다. 한편, 버크와 팽팽한 냉전을 벌이던 크리스티나는 그에게서 뜻밖의 청혼을 받게 된다.

#14. Wishin' And Hopin'
드디어 베일리가 추진하던 무료진료소가 이지의 후원금으로 개소한다. 하지만 이들의 부푼 기대와는 달리 첫날, 진료소에는 아무도 찾아오지 않는다. 조지는 캘리와 결혼하지만 그 사실을 인정하지 않는 친구들과 마찰을 빚는다.　한편, 메러디스의 엄마인 엘리스 그레이가 갑작스럽게 정신이 돌아와 모든 것을 기억해내는데...

#15. Walk On Water
메러디스는 엄마에게 심한 말을 들은 것 때문에 기분이 우울해져서 세상에서 그냥 사라졌으면 좋겠다는 생각을 한다. 이런 생각을 하며 욕조 물속에 잠수해있는 메러디스를 보고 셰퍼드는 그녀가 자살을 하려던 걸로 생각하고 걱정에 빠진다. 한편, 버크의 청혼을 받아들인 크리스티나는 메러디스에게 처음으로 알리려 하지만 그녀의 우울한 기분 때문에 차마 말을 못 꺼낸다.

#16. Drowning on Dry Land
환자의 몸부림에 떠밀러 바다에 빠진 메러디스는 헤엄치기를 포기하고 바다 밑으로 가라앉는다.　그녀가 없어진 걸 눈치 챈 셰퍼드는 메러디스와 함께 있던 소녀에게 메러디스의 행방을 묻고 소녀는 말없이 바다를 가리킨다.　이지는 차 밑에 깔린 환자가 경련을 일으키며 정신을 잃자, 마지막 수단으로 웨버 과장에게 전화를 건다. 웨버 과장은 드릴로 환자 머리뼈에 구멍을 뚫을 것을 이지에게 지시하고 이지는 한 번도 해본 적 없는 위험한 시술을 시도한다.

#17. Some kind of Miracle
사경을 헤매는 메러디스의 영혼이 사후세계로 가서 이미 오래 전에 세상을 떠난 데니와 딜런 반장, 보니, 리즈 간호사를 만난다. 이들은 생사의 갈림길에서 방황하는 메러디스에게 희망과 용기를 불어 넣는다. 삶의 의욕을 잃었던 메러디스는 이들과의 대화에서 잊고 있었던 사랑과 삶에 대한 열정을 깨닫고, 다시 이승으로 내려가는 선택을 하게 된다.

#18. Scars and Souvenirs
크리스티나가 스탠퍼드대에 다닐 때 사귀었던 콜린 멀로 교수가 외과 과장 후보로 초빙돼 온다. 버크는 크리스티나의 과거를 알게 되면서 질투를 느끼고, 이들의 약혼전선도 위협을 받는다. 한편 조지는 캘리가 부잣집 딸이라는 사실을 알게 되면서 갈등을 느끼고, 메러디스는 아버지 대처와 수잔을 저녁식사에 초대해 화해의 시간을 갖는다.

#19. My favorite Mistake
이지는 조지와의 관계를 친구들이 눈치를 챌까봐 조마조마해 하지만 마음 한편으론 조지와 자신이 신이 맺어준 짝이 아닐까 하는 생각을 한다. 하지만 조지는 술에 너무 취해서 아무 기억도 못한 채 출근을 한다.캘리는 아버지가 조지를 만나러 시애틀에 왔다는 연락을 받고 바짝 긴장한다.조지는 숙취 때문에 엉망인 상황에서 장인을 만나야하는 상황에 처한다.

#20. Time After Time
메러디스는 메러디스와 친해지려고 노력하는 수잔에게 부담스러움을 느끼며, 엄마 노릇을 하려는 수잔의 행동에 강한 반발심을 느낀다. 크리스티나는 자신의 결혼을 훼방 놓는 멀로 교수를 쫓아버리기 위해 버크에게 지나친 애정 표현을 하는 등의 온갖 방법을 동원한다. 한편, 이지는 자신의 딸 헤나가 백혈병으로 골수가 필요하다는 사실을 알게 되는데….

#21. Desire
인턴시험이 코 앞에 다가와 조지, 이지, 메러디스, 크리스티나는 공부에 열중한다. 한편 아마존에 갔다가 향토병으로 갑작스럽게 입원한 병원 이사장에게 잘 보이려고 전문의들은 서로 경쟁을 하고, 이지와 조지가 너무 가까운 것이 걱정된 캘리는 이지에게 남편을 돌려달라고 부탁한다.

#22. The Other Side of This Life, part 1
에디슨은 오래전부터 생각해왔던 임신을 실행하기위해 인공수정 전문가인 대학동기 나오미가 있는 LA로 여행을 떠난다. 한편, 메러디스의 새엄마인 수잔이 딸꾹질 때문에 진료소를 찾는데 그 일을 계기로 아버지인 대처와 대화를 나누게 되는….

#23. The Other Side of This Life, part 2
기분 전환으로 산타 모니카에 온 에디슨은 대체의학 전문가의 피트의 애정 공세에 활력을 얻는다. 아직 가족도, 기억도 찾지 못한 에바는 머릿속의 출혈을 막으면 기억을 되찾을 수도 있다는 셰퍼드의 말을 듣고 또 다시 뇌수술을 강행하지만 수술 후에도 기억이 돌아오지 않자 크게 낙담한다.　

#24. Testing 1-2-3
인턴 시험이 오늘로 다가왔지만 메러디스는 시험공부의 분주함을 뒤로 한 채 검은 옷을 차려입고 담담하게 수잔의 장례식에 갈 준비를 한다.　알렉스는 에바가 기억이 돌아왔으면서도 그걸 숨기고 있었다는 걸 알게 되고, 크리스티나는 내일로 다가온 결혼식 서약문을 쓰지 못해서 전전긍긍한다.

#25. Didn't We Almost Have It All
하혈을 하며 쓰러졌던 아델은 결국 유산을 하지만 웨버의 사랑을 다시한번 확인하게된다. 성대한 결혼식을 내켜하지 않던 크리스티나도 결혼식 준비를 하면서 조금씩 마음을 열어가는데, 결혼식 당일 손바닥에 적어놓은 결혼서약이 지워진 것을 알고 당황한 크리스티나에게 버크는 뜻밖의 선언을 한다. 한편, 메러디스와 셰퍼드의 갈등의 골은 깊어지기만 하는데….