고교 1년생 히비키 유타. 어느 날 잠에서 깨어 보니 자신이 기억 상실임을 알게 된다.
오래된 컴퓨터 화면 속에서 나타난 "하이퍼 에이전트 그리드맨"은 '너의 사명을 다하라'는 말을 남기고, 유타는 그말의 의미와 기억을 찾기 시작한다.
갑작스레 벌어진 일들로 혼란스럽지만, 클래스 메이트인 우츠미, 릿카, 아카네의 도움을 받아 하루 하루를 보낸다. 과연 그 평온한 날들은 지속될 수 있을까...

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