배트맨의 어린 시절… 현재는 고담시의 검사보가 된 레이첼과 브루스는 소꿉친구로 정원에서 놀다 브루스가 웅덩이에 빠지는 사고가 나고, 부모를 잃는 악 순환을 경험하는 과거의 악몽을 꾸는 그와 현재는 감옥 속에 갇힌 브루스 웨인의 처지가 완전히 바뀌었음을 보여 주는데…

출소를 며칠 앞두고 듀커드를 만나 산속에서 수련을 하게 된다. 수련을 마친 브루스 웨인은 부패와 범죄에 물든 고담시에 돌아오지만 가문의 기업으로부터는 배제되기 시작한다. 그러나 집사인 알프레드의 도움으로 자신의 꿈을 이뤄가는 과정에서 폭스와 짐 고든의 도움으로 배트맨이 되어가고, 악당들에게 매수 된 크레인 박사가 만든 신경 가스로 고담시를 몰살하려는 라스알굴 일당과 맞서 시민들을 구하고 사경을 헤매는 사랑하는 여자친구 레이첼을 구하는 등 초기 배트맨의 역할을 해내게 된다.

이 도시에 정의는 죽었다!

범죄와 부정부패를 제거하여 고담시를 지키려는 배트맨. 그는 짐 고든 형사와 패기 넘치는 고담시 지방 검사 하비덴트와 함께 도시를 범죄 조직으로부터 영원히 구원하고자 한다.
세 명의 의기투합으로 위기에 처한 악당들이 모인 자리에 보라색 양복을 입고 얼굴에 짙게 화장을 한 괴이한 존재가 나타나 ‘배트맨을 죽이자’는 사상 초유의 제안을 한다. 그는 바로 어떠한 룰도, 목적도 없는 사상 최악의 악당 미치광이 살인광대 ‘조커’!!

마침내 최강의 적을 만나다! 배트맨을 죽이고 고담시를 끝장내버리기 위한 조커의 광기 어린 행각에 도시는 혼란에 빠진다. 조커는 배트맨이 가면을 벗고 정체를 밝히지 않으면 멈추지 않겠다며 점점 배트맨을 조여온다. 한편, 배트맨은 낮엔 기업의 회장으로, 밤에는 가면을 쓴 배트맨으로 밤과 낮의 정체가 다른 자신과 달리 법을 통해 도시를 구원하는 하비덴트야말로 진정한 영웅이 아닐까 생각하게 된다. 조커를 막기 위해 직접 나서 영원히 존재를 감춘 밤의 기사가 될 것인가? 하비덴트에게 모든 걸 맡기고 이제 가면을 벗고 이중 생활의 막을 내릴 것인가. 갈림길에 선 그는 행동에 나서야만 한다.