전세계가 가장 사랑하는 파란 고슴도치가 수퍼 소닉2 에서 두 번째 모험으로 돌아왔다. 그린 힐스에 정착한 소닉은 자신이 진정한 히어로가 될 자질을 갖췄다는 것을 증명하고 싶어 한다. 그런 그를 시험할 위기는 닥터 로보트닉이 문명을 파괴할 힘을 가진 에메랄드를 찾기 위해 새로운 파트너 너클스와 함께 돌아오면서 닥쳐온다. 소닉은 동료 테일스와 함께 팀을 이뤄 에메랄드가 악당의 손에 들어가기 전에 먼저 발견하기 위한 여정을 떠난다.